1945年7月，孙立人率新1军返抵广西南宁，准备反攻广州。8月15日，日本宣布无条件投降。9月7日，孙立人率军进入广州，接受日军第23军投降。

抗战胜利后，新1军与新6军被调往东北进行内战，凭着优势武力，曾在作战初期取得上风，不过却因与杜聿明不和，孙立人被调回南京国防部任职，实际已远离战场。

1947年8月，蒋介石将孙立人调离东北，出任陆军副总司令兼陆军训练部司令，在南京成立陆军训练司令部。11月，孙立人将陆军训练部迁到台湾，并从新一军调去几百名他在税警总团和在缅甸作战时期的干部，一同前往台湾训练新兵，在台湾建立新军。

1948年10月，孙立人选定台湾凤山为新军练兵基地，开始他一生最后一次练兵。11月，孙立人将陆训部迁到凤山，并调新一军教导总队第9期毕业学员入台作为示范队。孙立人的原来的新军训练计划是要以新兵训练。但当时已无可能，改为训练现有部队。

1949年8月，陈毅华东野战军部叶飞10兵团攻克福州，10月又克厦门，准备攻击金门。金门告急，孙立人接电，即刻派精锐部队前往增援，孙立人的201师投入部分预备队后独立完成了反击，将对方压缩到古宁头。

1948年底，孙立人兼任东南军政长官公署副司令长官和台湾防卫司令。1949年8月，升台湾防卫总司令。制定实施台澎防卫计划，构建全岛防卫工事体系，整训撤台的80万败军。

1949年9月1日，孙立人正式就职台湾防卫司令，第201师10月在金门参加金门战役。11月，蒋中正在国民党中央非常委员会第二分会中提议孙立人再兼东南军政长官公署副长官，国防部亦随之发表新职。

1950年3月1日，蒋中正“复行视事”重任总统职，东南军政长官公署随之裁撤，孙接任陆军总司令兼台湾防卫总司令（当时陆军总司令部与台湾防卫总司令部址乃同一驻所）。

1951年5月，孙立人晋升陆军二级上将。

1952年4月，孙立人连任陆军总司令。1953年6月，孙立人在税警总团的老长官黄杰领三万军队，自越南富国岛到台湾。8月黄杰任台北卫戍司令。9月，晋升陆军二级上将。1954年6月24日黄杰任陆军总司令，孙立人任总统府参军长，失去兵权。

说 实话，孙立人就根本没有怎么打到仗。🇹🇼