小智和皮卡丘在一片人烟稀少的森林里迷路了，不过小智一点也不担心，因为他感觉一定会有好事发生。

小智：皮卡丘，我们先在这里休息一下吧。

小智走出草丛坐在一块石头上休息。这时他们发现了一只正在喝水的走路草，小智想它或许能帮他们走出森林，于是就走上前去，结果不小心吓到了它；皮卡丘跳过去拦住了它，突然一只妙蛙种子冲出来用藤鞭把皮卡丘打到一边，看它的样子是在保护走路草。

小智：妙蛙种子，我们不是坏人，我们只是想问走路草走出森林的路而已。

皮卡丘：皮卡～皮卡～

妙蛙种子没有理小智和皮卡丘，带着走路草跑了。

小智：皮卡丘，我们去找它们。

小智很想收服妙蛙种子，于是就带着皮卡丘往它们逃跑的方向前进。他们走到一座吊桥上，没想到吊桥忽然断了，还好小智眼疾手快，跳到了对面；一路上小智和皮卡丘遇到了各种各样的陷阱，小智和皮卡丘都全部轻松躲过了。来到一间木屋，周围有许多神奇宝贝，但神奇宝贝看到他们就躲了起来，好像很怕他们。

小翠：你们是谁？

小智：我是真新镇的小智，是神奇宝贝训练家，它是我的搭档皮卡丘。我们只是迷路了才来到这里，并没有什么恶意。

小翠：这样啊，我是小翠，这里是神奇宝贝乡，是神奇宝贝的疗养院。这里有很多受伤和被抛弃的神奇宝贝，我在这里照顾受伤的神奇宝贝们，之前的陷阱是为了防止外面的人前来捕捉那些我正在照顾的神奇宝贝而设下的。

之后小智就开始帮小翠照顾神奇宝贝，皮卡丘很快就和其它的神奇宝贝打成了一片。

小智：走路草对不起，我刚才吓到你了。

走路草原谅了小智。

妙蛙种子：嘎纳！嘎纳！嘎纳！

妙蛙种子忽然冲出来撞向小智，被小智用一只手挡住了。

小智：(用手撑着妙蛙种子的头)妙蛙种子，你冷静一点，我们不是你的敌人。

皮卡丘：皮卡丘～

小翠：妙蛙种子它是在保护村子，它想要保护受伤的神奇宝贝们不受外来的敌人的攻击，其实妙蛙种子它是这个村子里的保镖。

妙蛙种子还在推小智，想要小智离开。

小翠：没问题的，妙蛙种子。

“轰——！！！”一个像巨蛋球场一样巨大的机器从天而降。

小智：什么？

火箭队开场白只说到一半

武藏：这里所有的神奇宝贝我们全部都接收了。

小次郎：就是这样。

喵喵：这就是你们用机关陷害我们的惩罚啊，喵～

说完机器伸出一根吸管，开始吸气。

小翠：大家快进木屋里！

小翠立刻带着神奇宝贝们逃进木屋里，走路草一不小心被吸了过去，幸好妙蛙种子用藤鞭把它拉了回来。小智立刻过去帮妙蛙种子进入木屋。

武藏：那个臭小鬼，他又想来破坏我们的好事。

小次郎：不过，所有人都聚集在一个地方正合我意。

喵喵：把那个破木屋一口气吸进来，喵～

火箭队立刻加大了吸力，就在他们以后要成功的时候，妙蛙种子突然出现在屋顶，用藤鞭改变了管子的方向，小智也趁机跑出来了

小智：出来吧，比比鸟，烈暴风！

两股风撞在一起形成了龙卷风，把火箭队连同机器一起吹飞了。

武藏、小次郎、喵喵：好讨厌的感觉啊！

小翠：(高兴)大家都平安无事，真是太好了。

妙蛙种子：(高兴)嘎纳～嘎纳

小翠：小智，你想要妙蛙种子对不对？

小智：是啊。

小翠：(抱起妙蛙种子)要是不嫌弃的话，你可以带它走哦。妙蛙种子牺牲自己，帮助这里弱小的神奇宝贝，但是继续这样下去的话，它会成为井底之蛙的；如果继续留在这里，它不会成长的，背上的植物也永远不会长大，所以我希望你能够带妙蛙种子到外面的世界去。

小智：(担心)那村子呢？

小翠：(看着所有的神奇宝贝)的确，妙蛙种子确实在保护村子方面有很大的贡献，但是神奇宝贝们是不能够永远停留在这个地方的；有些神奇宝贝的复健早就已经结束了，可是因为住在这里太舒服了，它们竟然不愿意回到外面的世界去；我希望它们恢复健康以后能够回到原来的地方去，希望这里的神奇宝贝们能够回到大自然；当然，如果有受伤的神奇宝贝过来，我会尽全力治疗它们的，但是当它们恢复健康后，我希望它们能够回到原来的地方，这就是我的愿望；所以我希望你带妙蛙种子到外面的世界去，它不是那种一辈子待在这里当保镖的神奇宝贝，它应该还可以更加的茁壮成长，妙蛙种子有属于它活跃的场所，对吧。小智，那就拜托你了。

小智：好，我明白了。

妙蛙种子：(对小翠)嘎纳～嘎纳～

小翠：(笑了笑)它说带它走可以，但条件是你要打败它才可以哦。

妙蛙种子：嘎纳(是的)

小智：好，上吧皮卡丘。

皮卡丘：皮卡！

妙蛙种子开始就用藤鞭，皮卡丘灵巧的躲过了藤鞭，这时妙蛙种子撞了过来

小智：铁尾。

皮卡丘立刻用铁尾迎击，妙蛙种子被击退后用藤鞭绑住了皮卡丘，用力的将皮卡丘往地上砸

小智：十万伏特。

皮卡丘的十万伏特通过藤鞭传到妙蛙种子身上，妙蛙种子被电翻。小智扔出精灵球，“咚！”的一声，成功收服了妙蛙种子。

小智：(高兴)好诶！我收服妙蛙种子了。

皮卡丘：(开心)皮卡丘～

小翠：(祝福)这是最好的结局了，小智。

妙蛙种子恢复后，与小翠告别，然后跟着小智踏上了旅途。

小翠：(挥手告别)再见了，你们要好好加油啊，妙蛙种子也要加油哦。

小智收服妙蛙种子后，继续踏上了前往枯叶市的道路，会有更美好的明天等着他们。